Специалист по молекулярному моделированию / Структурный биоинформатик

Команда учёных в области медицинской геномики ищет специалиста по молекулярному моделированию и вычислительной структурной биологии. Вам предстоит решать как фундаментальные задачи по интерпретации генетических мутаций, так и прикладные R&D-задачи по дизайну и оптимизации терапевтических белков и пептидов.

Обязанности:

• Проведение белок-белкового и белок-лигандного докинга (преимущественно пептиды, в меньшей степени – малые молекулы), моделирование белков в растворе и в мембране.
• Структурный анализ и интерпретация влияния миссенс-мутаций на функцию белков в рамках биомедицинских проектов отдела по поиску генетических основ патогенеза заболеваний.
• Дизайн белков с заданной функцией, оптимизация пептидных препаратов и терапевтических конструкций, деиммунизация белковых носителей.

• Профильное высшее образование (биоинформатика, биофизика, молекулярная биология, химия/вычислительная химия или смежные специальности).
• Опыт работы с программным пакетом GROMACS (или аналогичными инструментами для молекулярной динамики).
• Навыки проведения молекулярного докинга (белок-белковый, пептидный, белок-лигандный).
• Знание современных ML-инструментов структурной биологии (ProteinMPNN, AlphaFold / ESMFold и др.) и готовность применять их для дизайна белков de novo. Дополнительным преимуществом будет знание классических ML-инструментов и возможность их применения к структурным данным.
• Опыт визуализации структурных данных и подготовки графики для научных отчетов и публикаций.
• Понимание основ биомедицины, готовность работать на стыке вычислительных методов и экспериментальной биологии.

• Гибридный график работы после испытательного срока.
• Стабильная заработная плата по рынку и выше (обсуждается на собеседовании).
• Оформление по ТК РФ.
• Комфортный офис в 10 минутах от м. Щукинская.